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超薄切片是使用超薄切片機將樹脂包埋的樣本進行切片，切片厚度一般為50~80nm左右，用無碳方華膜銅網進行撈片，然后進行重金屬染色，染色完后常溫保存或者電鏡觀察拍照。
超薄切片及染色步驟：
1、修整樹脂塊：將包埋好的樹脂塊用單面刀片進行修整，暴露出需要的切片部位。
2、半薄切片及染色：使用半薄切片機或者超薄切片機切出半薄切片放入1%的亞甲藍（美籃）或者1%的甲苯胺藍中染色，水洗，再用載玻片撈片、用甘油或者水進行快速封片。
3、定位：觀察半薄切片，找到需要電鏡觀察的部位，再在樹脂樣本中找出需要的部位，用單面刀片修整出T型小臺。
4、超薄切片：定完位的樹脂樣本再用超薄切片機進行切片，切片厚度50~80nm，然后用無碳方華膜銅網進行撈片，常溫保存。
5、超薄切片染色：撈上超薄切片的銅網進行醋酸鈾和枸櫞酸鉛的雙重重金屬染色，染完后常溫保存或者電鏡觀察拍照。
超薄切片實驗代測
1、標本不能過硬，超薄切片機刀片使用的是進口鉆石刀片，價格昂貴，過硬的組織會嚴重損傷刀片；